Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERPINB3P29508 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms