Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCAP28676 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCAP28676 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCAP28676 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCAP28676 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GCAP28676 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCAP28676 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCAP28676 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCAP28676 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCAP28676 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCAP28676 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCAP28676 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCAP28676 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCAP28676 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCAP28676 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCAP28676 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCAP28676 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCAP28676 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCAP28676 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GCAP28676 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCAP28676 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCAP28676 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCAP28676 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCAP28676 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCAP28676 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCAP28676 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCAP28676 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCAP28676 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCAP28676 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCAP28676 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCAP28676 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCAP28676 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCAP28676 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCAP28676 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCAP28676 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCAP28676 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCAP28676 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GCAP28676 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCAP28676 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCAP28676 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCAP28676 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCAP28676 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCAP28676 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCAP28676 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCAP28676 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCAP28676 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCAP28676 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCAP28676 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCAP28676 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCAP28676 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCAP28676 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCAP28676 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCAP28676 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCAP28676 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCAP28676 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCAP28676 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCAP28676 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCAP28676 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCAP28676 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCAP28676 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCAP28676 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCAP28676 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCAP28676 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCAP28676 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCAP28676 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCAP28676 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCAP28676 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCAP28676 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCAP28676 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCAP28676 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCAP28676 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCAP28676 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCAP28676 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCAP28676 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCAP28676 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GCAP28676 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCAP28676 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCAP28676 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCAP28676 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCAP28676 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCAP28676 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCAP28676 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCAP28676 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCAP28676 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCAP28676 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCAP28676 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCAP28676 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCAP28676 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCAP28676 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCAP28676 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCAP28676 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCAP28676 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCAP28676 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCAP28676 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCAP28676 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCAP28676 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCAP28676 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCAP28676 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCAP28676 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GCAP28676 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms