Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMLP26374 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMLP26374 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMLP26374 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMLP26374 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMLP26374 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMLP26374 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMLP26374 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMLP26374 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMLP26374 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMLP26374 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMLP26374 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMLP26374 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMLP26374 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMLP26374 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMLP26374 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMLP26374 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMLP26374 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMLP26374 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMLP26374 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMLP26374 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMLP26374 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMLP26374 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMLP26374 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMLP26374 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMLP26374 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMLP26374 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMLP26374 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMLP26374 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMLP26374 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMLP26374 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMLP26374 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMLP26374 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMLP26374 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMLP26374 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMLP26374 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMLP26374 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMLP26374 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMLP26374 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMLP26374 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMLP26374 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMLP26374 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMLP26374 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMLP26374 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMLP26374 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMLP26374 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMLP26374 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMLP26374 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMLP26374 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMLP26374 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMLP26374 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMLP26374 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMLP26374 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMLP26374 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMLP26374 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMLP26374 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMLP26374 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMLP26374 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMLP26374 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMLP26374 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMLP26374 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMLP26374 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMLP26374 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMLP26374 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMLP26374 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMLP26374 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMLP26374 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMLP26374 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMLP26374 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMLP26374 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMLP26374 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMLP26374 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMLP26374 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMLP26374 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMLP26374 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMLP26374 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMLP26374 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMLP26374 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMLP26374 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMLP26374 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMLP26374 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMLP26374 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMLP26374 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMLP26374 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMLP26374 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMLP26374 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMLP26374 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMLP26374 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMLP26374 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMLP26374 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMLP26374 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMLP26374 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMLP26374 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMLP26374 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMLP26374 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMLP26374 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMLP26374 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMLP26374 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMLP26374 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHMLP26374 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms