Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTX3P26022 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTX3P26022 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTX3P26022 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTX3P26022 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTX3P26022 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTX3P26022 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTX3P26022 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTX3P26022 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTX3P26022 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTX3P26022 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTX3P26022 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTX3P26022 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTX3P26022 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTX3P26022 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTX3P26022 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTX3P26022 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTX3P26022 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTX3P26022 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTX3P26022 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTX3P26022 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTX3P26022 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTX3P26022 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTX3P26022 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTX3P26022 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTX3P26022 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTX3P26022 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTX3P26022 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTX3P26022 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTX3P26022 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTX3P26022 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTX3P26022 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTX3P26022 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTX3P26022 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTX3P26022 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTX3P26022 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTX3P26022 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTX3P26022 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTX3P26022 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTX3P26022 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTX3P26022 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTX3P26022 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTX3P26022 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTX3P26022 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTX3P26022 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTX3P26022 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTX3P26022 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTX3P26022 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTX3P26022 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTX3P26022 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTX3P26022 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTX3P26022 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTX3P26022 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTX3P26022 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTX3P26022 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTX3P26022 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTX3P26022 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTX3P26022 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTX3P26022 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTX3P26022 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTX3P26022 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTX3P26022 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTX3P26022 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTX3P26022 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTX3P26022 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTX3P26022 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTX3P26022 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTX3P26022 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTX3P26022 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTX3P26022 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTX3P26022 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTX3P26022 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTX3P26022 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTX3P26022 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTX3P26022 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTX3P26022 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTX3P26022 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTX3P26022 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTX3P26022 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTX3P26022 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTX3P26022 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTX3P26022 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTX3P26022 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTX3P26022 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTX3P26022 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTX3P26022 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTX3P26022 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTX3P26022 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTX3P26022 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTX3P26022 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTX3P26022 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTX3P26022 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTX3P26022 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTX3P26022 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTX3P26022 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTX3P26022 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTX3P26022 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTX3P26022 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTX3P26022 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTX3P26022 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms