Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSSP25774 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSSP25774 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSSP25774 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSSP25774 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSSP25774 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSSP25774 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSSP25774 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSSP25774 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSSP25774 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSSP25774 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSSP25774 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTSSP25774 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSSP25774 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSSP25774 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSSP25774 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSSP25774 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSSP25774 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSSP25774 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSSP25774 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSSP25774 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSSP25774 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSSP25774 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSSP25774 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSSP25774 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSSP25774 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSSP25774 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSSP25774 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSSP25774 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSSP25774 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSSP25774 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSSP25774 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSSP25774 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSSP25774 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSSP25774 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSSP25774 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSSP25774 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSSP25774 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSSP25774 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSSP25774 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSSP25774 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSSP25774 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSSP25774 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSSP25774 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSSP25774 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSSP25774 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSSP25774 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSSP25774 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSSP25774 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSSP25774 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTSSP25774 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSSP25774 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSSP25774 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSSP25774 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSSP25774 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSSP25774 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSSP25774 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSSP25774 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSSP25774 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSSP25774 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSSP25774 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSSP25774 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSSP25774 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSSP25774 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSSP25774 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSSP25774 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSSP25774 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSSP25774 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSSP25774 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSSP25774 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSSP25774 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSSP25774 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSSP25774 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSSP25774 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSSP25774 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSSP25774 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSSP25774 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSSP25774 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSSP25774 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSSP25774 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSSP25774 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSSP25774 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSSP25774 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSSP25774 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSSP25774 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSSP25774 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSSP25774 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTSSP25774 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSSP25774 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSSP25774 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSSP25774 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSSP25774 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSSP25774 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSSP25774 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSSP25774 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSSP25774 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSSP25774 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSSP25774 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSSP25774 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTSSP25774 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms