Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
RAB3BP20337 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB3BP20337 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms