Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2CP19387 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR2CP19387 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR2CP19387 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR2CP19387 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR2CP19387 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR2CP19387 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR2CP19387 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR2CP19387 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR2CP19387 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR2CP19387 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR2CP19387 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR2CP19387 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR2CP19387 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR2CP19387 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2CP19387 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2CP19387 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2CP19387 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2CP19387 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2CP19387 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2CP19387 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2CP19387 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2CP19387 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2CP19387 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2CP19387 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2CP19387 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2CP19387 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2CP19387 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2CP19387 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2CP19387 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2CP19387 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2CP19387 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2CP19387 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2CP19387 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms