Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPI1P17947 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPI1P17947 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPI1P17947 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPI1P17947 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPI1P17947 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPI1P17947 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPI1P17947 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPI1P17947 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPI1P17947 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPI1P17947 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPI1P17947 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPI1P17947 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPI1P17947 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPI1P17947 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPI1P17947 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPI1P17947 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPI1P17947 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPI1P17947 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPI1P17947 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPI1P17947 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPI1P17947 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPI1P17947 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPI1P17947 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPI1P17947 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPI1P17947 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPI1P17947 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPI1P17947 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPI1P17947 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPI1P17947 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPI1P17947 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPI1P17947 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPI1P17947 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPI1P17947 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPI1P17947 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPI1P17947 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPI1P17947 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPI1P17947 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPI1P17947 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPI1P17947 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPI1P17947 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPI1P17947 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPI1P17947 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPI1P17947 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPI1P17947 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPI1P17947 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPI1P17947 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPI1P17947 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPI1P17947 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPI1P17947 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPI1P17947 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPI1P17947 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPI1P17947 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPI1P17947 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPI1P17947 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPI1P17947 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPI1P17947 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPI1P17947 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPI1P17947 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPI1P17947 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPI1P17947 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPI1P17947 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPI1P17947 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPI1P17947 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms