Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TOP1P11387 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TOP1P11387 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TOP1P11387 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TOP1P11387 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TOP1P11387 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOP1P11387 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TOP1P11387 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOP1P11387 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOP1P11387 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TOP1P11387 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TOP1P11387 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TOP1P11387 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TOP1P11387 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TOP1P11387 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP1P11387 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP1P11387 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP1P11387 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP1P11387 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP1P11387 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP1P11387 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP1P11387 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP1P11387 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP1P11387 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP1P11387 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP1P11387 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP1P11387 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP1P11387 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP1P11387 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP1P11387 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP1P11387 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP1P11387 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP1P11387 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP1P11387 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP1P11387 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP1P11387 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP1P11387 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP1P11387 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP1P11387 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP1P11387 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP1P11387 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP1P11387 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP1P11387 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP1P11387 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TOP1P11387 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOP1P11387 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOP1P11387 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOP1P11387 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOP1P11387 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOP1P11387 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOP1P11387 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOP1P11387 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOP1P11387 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOP1P11387 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOP1P11387 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOP1P11387 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOP1P11387 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOP1P11387 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOP1P11387 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOP1P11387 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOP1P11387 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOP1P11387 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOP1P11387 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOP1P11387 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOP1P11387 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOP1P11387 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOP1P11387 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOP1P11387 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOP1P11387 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOP1P11387 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOP1P11387 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOP1P11387 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOP1P11387 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOP1P11387 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOP1P11387 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOP1P11387 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOP1P11387 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOP1P11387 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOP1P11387 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOP1P11387 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOP1P11387 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TOP1P11387 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOP1P11387 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOP1P11387 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOP1P11387 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOP1P11387 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOP1P11387 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TOP1P11387 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOP1P11387 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOP1P11387 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOP1P11387 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOP1P11387 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOP1P11387 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOP1P11387 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOP1P11387 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOP1P11387 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOP1P11387 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TOP1P11387 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOP1P11387 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOP1P11387 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms