Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM225BP0DP42 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms