Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms