Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00032P0C843 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00032P0C843 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00032P0C843 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00032P0C843 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00032P0C843 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00032P0C843 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00032P0C843 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00032P0C843 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00032P0C843 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00032P0C843 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00032P0C843 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00032P0C843 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00032P0C843 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00032P0C843 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00032P0C843 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00032P0C843 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00032P0C843 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00032P0C843 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00032P0C843 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00032P0C843 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00032P0C843 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00032P0C843 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00032P0C843 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC00032P0C843 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms