Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLA1P09884 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLA1P09884 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLA1P09884 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLA1P09884 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLA1P09884 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLA1P09884 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLA1P09884 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLA1P09884 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLA1P09884 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLA1P09884 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLA1P09884 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLA1P09884 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLA1P09884 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLA1P09884 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLA1P09884 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLA1P09884 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLA1P09884 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLA1P09884 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLA1P09884 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLA1P09884 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLA1P09884 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
POLA1P09884 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
POLA1P09884 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
POLA1P09884 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
POLA1P09884 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
POLA1P09884 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
POLA1P09884 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
POLA1P09884 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
POLA1P09884 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
POLA1P09884 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
POLA1P09884 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
POLA1P09884 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
POLA1P09884 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
POLA1P09884 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
POLA1P09884 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
POLA1P09884 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
POLA1P09884 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
POLA1P09884 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
POLA1P09884 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
POLA1P09884 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLA1P09884 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLA1P09884 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLA1P09884 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLA1P09884 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLA1P09884 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLA1P09884 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLA1P09884 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLA1P09884 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLA1P09884 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLA1P09884 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLA1P09884 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLA1P09884 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLA1P09884 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLA1P09884 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLA1P09884 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLA1P09884 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLA1P09884 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLA1P09884 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLA1P09884 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLA1P09884 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLA1P09884 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLA1P09884 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLA1P09884 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLA1P09884 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLA1P09884 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLA1P09884 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLA1P09884 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLA1P09884 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLA1P09884 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLA1P09884 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLA1P09884 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLA1P09884 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLA1P09884 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLA1P09884 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLA1P09884 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLA1P09884 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLA1P09884 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLA1P09884 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLA1P09884 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLA1P09884 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLA1P09884 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLA1P09884 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLA1P09884 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLA1P09884 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLA1P09884 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLA1P09884 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLA1P09884 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLA1P09884 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
POLA1P09884 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
POLA1P09884 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLA1P09884 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLA1P09884 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLA1P09884 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLA1P09884 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
POLA1P09884 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLA1P09884 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLA1P09884 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLA1P09884 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
POLA1P09884 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms