Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCNE2O96020 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms