Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24BO95487 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms