Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSVO60911 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSVO60911 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSVO60911 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSVO60911 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSVO60911 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSVO60911 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSVO60911 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSVO60911 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSVO60911 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSVO60911 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSVO60911 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSVO60911 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSVO60911 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSVO60911 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSVO60911 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSVO60911 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSVO60911 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSVO60911 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSVO60911 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSVO60911 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSVO60911 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSVO60911 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSVO60911 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSVO60911 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSVO60911 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSVO60911 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSVO60911 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSVO60911 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSVO60911 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSVO60911 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSVO60911 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSVO60911 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSVO60911 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSVO60911 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSVO60911 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSVO60911 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSVO60911 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSVO60911 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSVO60911 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSVO60911 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSVO60911 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSVO60911 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSVO60911 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSVO60911 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSVO60911 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSVO60911 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSVO60911 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSVO60911 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSVO60911 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSVO60911 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSVO60911 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSVO60911 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSVO60911 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSVO60911 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSVO60911 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSVO60911 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSVO60911 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSVO60911 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSVO60911 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSVO60911 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSVO60911 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSVO60911 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSVO60911 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSVO60911 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSVO60911 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSVO60911 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSVO60911 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSVO60911 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSVO60911 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSVO60911 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSVO60911 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSVO60911 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSVO60911 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSVO60911 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSVO60911 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTSVO60911 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTSVO60911 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTSVO60911 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTSVO60911 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTSVO60911 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms