Protein–RNA interactions for Protein: O60542

PSPN, Persephin, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPNO60542 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSPNO60542 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSPNO60542 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PSPNO60542 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSPNO60542 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSPNO60542 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSPNO60542 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSPNO60542 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSPNO60542 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSPNO60542 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSPNO60542 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSPNO60542 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PSPNO60542 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PSPNO60542 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSPNO60542 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSPNO60542 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSPNO60542 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSPNO60542 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSPNO60542 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PSPNO60542 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSPNO60542 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSPNO60542 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSPNO60542 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSPNO60542 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSPNO60542 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSPNO60542 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSPNO60542 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSPNO60542 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSPNO60542 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSPNO60542 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSPNO60542 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSPNO60542 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSPNO60542 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSPNO60542 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSPNO60542 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSPNO60542 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSPNO60542 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PSPNO60542 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSPNO60542 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSPNO60542 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSPNO60542 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSPNO60542 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSPNO60542 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSPNO60542 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSPNO60542 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSPNO60542 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSPNO60542 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSPNO60542 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSPNO60542 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSPNO60542 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PSPNO60542 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSPNO60542 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSPNO60542 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSPNO60542 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSPNO60542 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSPNO60542 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSPNO60542 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSPNO60542 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSPNO60542 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSPNO60542 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSPNO60542 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSPNO60542 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms