Protein–RNA interactions for Protein: O60220

TIMM8A, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim8 A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM8AO60220 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms