Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 AC022762.2-201ENST00000600308 1353 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 AC010422.1-201ENST00000414548 543 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MAP3K13O43283 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms