Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms