Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM200CA6NKL6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM200CA6NKL6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms