Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARFGEF1Q9Y6D6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARFGEF1Q9Y6D6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARFGEF1Q9Y6D6 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGEF1Q9Y6D6 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGEF1Q9Y6D6 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGEF1Q9Y6D6 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARFGEF1Q9Y6D6 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms