Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AUP1Q9Y679 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms