Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W3

KLF2, Krueppel-like factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF2Q9Y5W3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF2Q9Y5W3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF2Q9Y5W3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF2Q9Y5W3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF2Q9Y5W3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF2Q9Y5W3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF2Q9Y5W3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF2Q9Y5W3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF2Q9Y5W3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF2Q9Y5W3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF2Q9Y5W3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF2Q9Y5W3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF2Q9Y5W3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF2Q9Y5W3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF2Q9Y5W3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF2Q9Y5W3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF2Q9Y5W3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF2Q9Y5W3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF2Q9Y5W3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF2Q9Y5W3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF2Q9Y5W3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF2Q9Y5W3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF2Q9Y5W3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF2Q9Y5W3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF2Q9Y5W3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF2Q9Y5W3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF2Q9Y5W3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF2Q9Y5W3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF2Q9Y5W3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF2Q9Y5W3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLF2Q9Y5W3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KLF2Q9Y5W3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KLF2Q9Y5W3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF2Q9Y5W3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms