Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HDGFL3Q9Y3E1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms