Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNIP3Q9Y2W7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms