Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PNMA8BQ9ULN7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms