Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ZNF608Q9ULD9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNF608Q9ULD9 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
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