Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HDAC9Q9UKV0 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms