Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCNL1Q9UK58 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms