Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM5BQ9UGL1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KDM5BQ9UGL1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms