Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms