Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC6Q9UBN7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms