Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL9Q9P2J3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL9Q9P2J3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms