Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYH9

UTP6, U3 small nucleolar RNA-associated protein 6 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP6Q9NYH9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UTP6Q9NYH9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms