Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms