Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM6Q9NX76 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM6Q9NX76 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM6Q9NX76 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM6Q9NX76 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM6Q9NX76 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM6Q9NX76 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM6Q9NX76 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM6Q9NX76 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM6Q9NX76 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM6Q9NX76 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM6Q9NX76 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM6Q9NX76 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM6Q9NX76 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM6Q9NX76 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM6Q9NX76 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM6Q9NX76 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM6Q9NX76 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM6Q9NX76 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM6Q9NX76 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM6Q9NX76 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM6Q9NX76 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM6Q9NX76 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CMTM6Q9NX76 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms