Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX18

SDHAF2, Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF2Q9NX18 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDHAF2Q9NX18 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms