Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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ABCF3Q9NUQ8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ABCF3Q9NUQ8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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