Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF275Q9NSD4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF275Q9NSD4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF275Q9NSD4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF275Q9NSD4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF275Q9NSD4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF275Q9NSD4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF275Q9NSD4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF275Q9NSD4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF275Q9NSD4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF275Q9NSD4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF275Q9NSD4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF275Q9NSD4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF275Q9NSD4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF275Q9NSD4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF275Q9NSD4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF275Q9NSD4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF275Q9NSD4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF275Q9NSD4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF275Q9NSD4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF275Q9NSD4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF275Q9NSD4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF275Q9NSD4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF275Q9NSD4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF275Q9NSD4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF275Q9NSD4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms