Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SALL1Q9NSC2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms