Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB9

ACKR4, Atypical chemokine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR4Q9NPB9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACKR4Q9NPB9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms