Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
APOBEC3GQ9HC16 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOBEC3GQ9HC16 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOBEC3GQ9HC16 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOBEC3GQ9HC16 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOBEC3GQ9HC16 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
APOBEC3GQ9HC16 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOBEC3GQ9HC16 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOBEC3GQ9HC16 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOBEC3GQ9HC16 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOBEC3GQ9HC16 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOBEC3GQ9HC16 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOBEC3GQ9HC16 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOBEC3GQ9HC16 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOBEC3GQ9HC16 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOBEC3GQ9HC16 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOBEC3GQ9HC16 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOBEC3GQ9HC16 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOBEC3GQ9HC16 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOBEC3GQ9HC16 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOBEC3GQ9HC16 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOBEC3GQ9HC16 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOBEC3GQ9HC16 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOBEC3GQ9HC16 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOBEC3GQ9HC16 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOBEC3GQ9HC16 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOBEC3GQ9HC16 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOBEC3GQ9HC16 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOBEC3GQ9HC16 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
APOBEC3GQ9HC16 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
APOBEC3GQ9HC16 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
APOBEC3GQ9HC16 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
APOBEC3GQ9HC16 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms