Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 AL122008.3-201ENST00000412483 1723 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SENP3Q9H4L4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 ATP6AP2-202ENST00000423649 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 OR13Z2P-201ENST00000606338 555 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 AC087235.1-201ENST00000538297 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 LGALS14-201ENST00000360675 773 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 AADACP1-203ENST00000471766 707 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 KLRD1-210ENST00000543777 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 ADAL-204ENST00000562188 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 AL365259.1-201ENST00000606334 509 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 AC090568.2-206ENST00000521936 1469 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SENP3Q9H4L4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms