Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CEP44Q9C0F1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEP44Q9C0F1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms