Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
EDEM3Q9BZQ6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms