Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PUS3Q9BZE2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PUS3Q9BZE2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms