Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCGF6Q9BYE7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCGF6Q9BYE7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms