Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
KDM5DQ9BY66 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
KDM5DQ9BY66 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM5DQ9BY66 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KDM5DQ9BY66 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms