Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK-6Q9BXR3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms